Reconnaissance et coupures spécifiques d'ADN double brin à l'aide d'oligonucléotides ou de PNA porteurs d'une nucléase chimique / Bigey, Pascal  

Public ISBD Titre : Reconnaissance et coupures spécifiques d'ADN double brin à l'aide d'oligonucléotides ou de PNA porteurs d'une nucléase chimique Titre original : Cleavage of double-stranded dna by hybrid molecules oligonucleotide-metalloporphyrin or pna-metalloporphyrin Type de document : texte imprimé Auteurs : Bigey, Pascal, Auteur ; Bernard Meunier, Directeur de thèse Année de publication : 1995 Langues : Français (fre) Anglais (eng) Tags : ACIDES NUCLÉIQUES  ANALYSE  EXPRESSION GÉNIQUE  TRADUCTION GÉNÉTIQUE  TRANSCRIPTION GÉNÉTIQUE  ADN NUCLEIC ACIDS  ANALYSIS  GENE EXPRESSION  GENE TRANSLATION  GENE TRANSCRIPTION  DNA Résumé : "Une première partie de ce travail est consacré à la synthèse de différentes porphyrines cationiques de fer(iii) ou de manganèse(iii), et à leur caractérisation précisée par spectrométrie de masse par électrospray. Ces composés, qui sont des nucléases chimiques artificielles efficaces, sont ensuite couples sur des oligonucléotides ou des pna fonctionnalisés par des fonctions aminées primaire (les pna étant des analogues d'oligonucléotides possédant un squelette peptidique neutre). Les molécules hybrides oligonucléotide-métalloporphyrine (ou pna-métalloporphyrine) obtenues possèdent une partie de reconnaissance de l’ADN double brin (l'oligonucléotide ou le pna), et une nucléase chimique (la métalloporphyrine). L'objectif suivant a été d'hybrider dans le grand sillon de l’ADN ces molécules hybrides, afin de former une triple hélice et de dégrader l’ADN double brin de façon spécifique. En effet, la métalloporphyrine activée par l'intermédiaire d'un oxydant donneur d'atome d'oxygène, provoquera des coupures de l’ADN à l'endroit de la formation de la triple hélice. L'influence de la longueur et de la nature du lien entre l'oligonucléotide et la métalloporphyrine a été étudiée. Le meilleur résultat a été obtenu avec un lien polyamine : la spermine. Cette molécule possède une bonne affinité pour l’ADN, et elle a permis d'obtenir des structures en triple hélice stables jusqu'à 40c, c'est-à-dire au-dessus de la température physiologique. Si la spermine est remplacée par une diamine aliphatique, la triple hélice n'est stable que jusqu'à 30c. La dégradation du fragment d’ADN double brin obtenue avec le lien spermine a été de l'ordre de 70-80%." "A first part of this work is devoted to the synthesis of different cationic porphyrins of iron(iii) or manganese(iii), and to their precise characterization by electrospray mass spectrometry. These compounds, which are efficient artificial chemical nucleases, are then coupled to oligonucleotides or pna functionalized by primary amine functions (pna being oligonucleotide analogues having a neutral peptide skeleton). The oligonucleotide-metalloporphyrin (or pna-metalloporphyrin) hybrid molecules obtained have a double-stranded DNA recognition part (the oligonucleotide or pna), and a chemical nuclease (the metalloporphyrin). The next objective was to hybridize these hybrid molecules in the major groove of DNA, in order to form a triple helix and to degrade the double-stranded DNA in a specific way. Indeed, the metalloporphyrin activated by through an oxygen atom-donating oxidant, will cause DNA breaks at the site of triple helix formation. The influence of the length and nature of the link between the oligonucleotide and the metalloporphyrin was studied. The best result was obtained with a polyamine link: spermine. This molecule has a good affinity for DNA, and it made it possible to obtain triple helix structures stable up to 40c, that is, above physiological temperature. If spermine is replaced by an aliphatic diamine, the triple helix is ??only stable up to 30c. The degradation of the double-stranded DNA fragment obtained with the spermine link was in the order of 70-80%." Document : Thèse de Doctorat Etablissement_delivrance : Université de Toulouse 3 Date_soutenance : 15/09/1995 Ecole_doctorale : Sciences de la Matière Domaine : Chimie des Biomolécules Localisation : LCC En ligne : https://theses.fr/1995TOU30152 Reconnaissance et coupures spécifiques d'ADN double brin à l'aide d'oligonucléotides ou de PNA porteurs d'une nucléase chimique = Cleavage of double-stranded dna by hybrid molecules oligonucleotide-metalloporphyrin or pna-metalloporphyrin [texte imprimé] / Bigey, Pascal, Auteur ; Bernard Meunier, Directeur de thèse . - 1995. Langues : Français (fre) Anglais (eng) Tags : ACIDES NUCLÉIQUES  ANALYSE  EXPRESSION GÉNIQUE  TRADUCTION GÉNÉTIQUE  TRANSCRIPTION GÉNÉTIQUE  ADN NUCLEIC ACIDS  ANALYSIS  GENE EXPRESSION  GENE TRANSLATION  GENE TRANSCRIPTION  DNA Résumé : "Une première partie de ce travail est consacré à la synthèse de différentes porphyrines cationiques de fer(iii) ou de manganèse(iii), et à leur caractérisation précisée par spectrométrie de masse par électrospray. Ces composés, qui sont des nucléases chimiques artificielles efficaces, sont ensuite couples sur des oligonucléotides ou des pna fonctionnalisés par des fonctions aminées primaire (les pna étant des analogues d'oligonucléotides possédant un squelette peptidique neutre). Les molécules hybrides oligonucléotide-métalloporphyrine (ou pna-métalloporphyrine) obtenues possèdent une partie de reconnaissance de l’ADN double brin (l'oligonucléotide ou le pna), et une nucléase chimique (la métalloporphyrine). L'objectif suivant a été d'hybrider dans le grand sillon de l’ADN ces molécules hybrides, afin de former une triple hélice et de dégrader l’ADN double brin de façon spécifique. En effet, la métalloporphyrine activée par l'intermédiaire d'un oxydant donneur d'atome d'oxygène, provoquera des coupures de l’ADN à l'endroit de la formation de la triple hélice. L'influence de la longueur et de la nature du lien entre l'oligonucléotide et la métalloporphyrine a été étudiée. Le meilleur résultat a été obtenu avec un lien polyamine : la spermine. Cette molécule possède une bonne affinité pour l’ADN, et elle a permis d'obtenir des structures en triple hélice stables jusqu'à 40c, c'est-à-dire au-dessus de la température physiologique. Si la spermine est remplacée par une diamine aliphatique, la triple hélice n'est stable que jusqu'à 30c. La dégradation du fragment d’ADN double brin obtenue avec le lien spermine a été de l'ordre de 70-80%." "A first part of this work is devoted to the synthesis of different cationic porphyrins of iron(iii) or manganese(iii), and to their precise characterization by electrospray mass spectrometry. These compounds, which are efficient artificial chemical nucleases, are then coupled to oligonucleotides or pna functionalized by primary amine functions (pna being oligonucleotide analogues having a neutral peptide skeleton). The oligonucleotide-metalloporphyrin (or pna-metalloporphyrin) hybrid molecules obtained have a double-stranded DNA recognition part (the oligonucleotide or pna), and a chemical nuclease (the metalloporphyrin). The next objective was to hybridize these hybrid molecules in the major groove of DNA, in order to form a triple helix and to degrade the double-stranded DNA in a specific way. Indeed, the metalloporphyrin activated by through an oxygen atom-donating oxidant, will cause DNA breaks at the site of triple helix formation. The influence of the length and nature of the link between the oligonucleotide and the metalloporphyrin was studied. The best result was obtained with a polyamine link: spermine. This molecule has a good affinity for DNA, and it made it possible to obtain triple helix structures stable up to 40c, that is, above physiological temperature. If spermine is replaced by an aliphatic diamine, the triple helix is ??only stable up to 30c. The degradation of the double-stranded DNA fragment obtained with the spermine link was in the order of 70-80%." Document : Thèse de Doctorat Etablissement_delivrance : Université de Toulouse 3 Date_soutenance : 15/09/1995 Ecole_doctorale : Sciences de la Matière Domaine : Chimie des Biomolécules Localisation : LCC En ligne : https://theses.fr/1995TOU30152

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